Der Haupt-eMule-Client wurde verbessert, um eine Version namens eMule Plus einzuschließen. Die verbesserte und anpassbare grafische Benutzeroberfläche (GUI), der Webserver, der eine Fernsteuerung des Clients ermöglicht, und das Team an Übersetzern, die den Client in mehrere Sprachen übersetzt hat, sind einige der bemerkenswertesten Merkmale von eMule Plus. Darüber hinaus wird jede Version von eMule Plus von einem Team von Alpha-Testern gründlich getestet, um Probleme zu reduzieren. Die Fähigkeit, Bewertungen und Kommentare anderer Benutzer anzuzeigen, um die Qualität einer Datei zu bewerten, eine bessere Handhabung von A4AF-Dateien (angefordert von einer anderen Datei) und die Möglichkeit, Quellen für spätere Abrufe zu speichern, sind weitere interessante Funktionen von eMule Plus.

Darüber hinaus bietet eMule Plus eine Vielzahl von Optionen zur Verbesserung der Benutzererfahrung und -leistung. Beispielsweise gibt es automatisierte Optionen zum Prüfen von falschen Dateien und spezifische Optimierungen für SSE/ MMX/ AMD-Prozessoren. Um Platzprobleme auf der Festplatte oder einen Verlust der Schriftart während des Downloads zu vermeiden, können Sie auch im Voraus den gesamten für eine Datei benötigten Speicherplatz zuweisen. Darüber hinaus wurde das Layout der Client- und Dateiinformationsfenster verbessert und es gibt vordefinierte Kategorien, um Dateien nach Status oder Medientyp zu sortieren.

Ein Sitzungstimer, der anzeigt, wie lange der Client läuft, die Möglichkeit, Flaggen entfernter Benutzer anzuzeigen, und länderspezifische Statistiken sind einige der vielen interessanten Funktionen von eMule Plus. Zusätzlich bietet eMule Plus wichtige physikalische Benachrichtigungen zum Status von Dateien in der Warteschleife und einen integrierten IRC-Client zum Chatten während des Downloads von Dateien.

eMule Plus enthält keine Spyware oder Adware und wird immer kostenlos sein. In eMule Plus beträgt das Verhältnis von Downloads zu Uploads 1:3 für Uploads kleiner als 4 KB/s und 1:1 für Uploads zwischen 4 und 10 KB/s. Wenn Sie jedoch mit mehr als 10 KB/s hochladen, gibt es kein Download-Limit.

Wenn Sie zu einem Server verlinkt haben und dann auf einen anderen doppelklicken, werden Sie von dem ursprünglichen Server abgeschnitten, bevor Sie versuchen, eine Verbindung zum nächsten Server herzustellen.

Einige Clients müssen über den Server eine Verbindung zu Ihrem Client herstellen, was als LowID bekannt ist. LowID-Clients können Dateien über den Server übertragen, haben jedoch eine geringere Wahrscheinlichkeit, eine Verbindung zu bekannten Servern herzustellen. Angenommen, Sie haben auf eMule Plus aktualisiert und haben jetzt eine LowID. In diesem Fall behandelt die Firewall wahrscheinlich die neueste Version als eine völlig andere Anwendung, was die Hinzufügung einer Zugriffsregel erforderlich macht.

Die neueste Iteration von eMule Plus, 1.2e, wurde am 18. April 2009 veröffentlicht. Dies bedeutet, dass es seit mehr als 12 Jahren keine Aktualisierung und Wartung durch die Entwickler des Software gegeben hat.